Hablamos de bioingeniería aplicada al paisaje para englobar todas las técnicas de bioingeniería aplicadas en el entorno con motivos estructurales y consecuentemente paisajísticos. Desde un punto de vista de los materiales, podemos clasificarla en ingeniería naturalística (conjunto de técnicas que utilizan material vivo y materias primas primarias como troncos, piedras, tierra...) e ingeniería biofísica (conjunto de técnicas que utilizan material vivo y productos elaborados como redes, geosintéticos, etc.) En estas técnicas, los seres vivos que realizan el trabajo son plantas, por lo tanto, a los objetivos estructurales se le añaden ventajas ambientales.

La norma principal es que siempre tenemos que trabajar con especies autóctonas para solucionar problemas y mejorar el buen estado ecológico de los espacios en los que trabajamos. En las técnicas de bioingeniería aplicada a ríos para mejorar la calidad de las aguas se trabaja con hidrófilos y macrófitos que a su vez proporcionan un hábitat adecuado para las bacterias que realizan la descomposición de la materia orgánica.